允许抵扣的进项税额的计算方法如下：1.一般纳税人购进货物、劳务、服务等时，按照取得的增值税专用发票上注明的增值税税额抵扣。
2.一般纳税人购进农产品，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和13%的扣除率计算进项税额抵扣。
3.一般纳税人购进或者销售货物以及在生产经营过程中支付运输费用的，按照运输费用结算单据上注明的运输费用金额和9%的扣除率计算进项税额抵扣。
需要注意的是，进项税额的抵扣需要符合税法规定的条件，如纳税人必须是一般纳税人、购进的货物或劳务必须用于生产经营等。同时，进项税额的抵扣也需要按照规定的程序进行申报和抵扣。
