次声波武器面临的最大难题是声压强度问题。日常生活中的许多因素如风、海浪、燃烧、麻雀拍打翅膀甚至地震都会产生次声波，但这些次声波并不具备致死效应。要制造足够强度的次声波，需要的能量级别远非圆珠笔弹簧所能提供。只有达到足够强度，声波才可能在人体内产生能量迭代，实现杀伤效果。然而，随着波形复杂度的增加，需要的能量和持续时间也会相应提高，这使得制造次声波的难度显著增加。
错误观点认为普通的音响能产生次声波，但实际上，市面上的音响通常无法响应20赫兹以下的频率，因此不具备产生次声波的能力。即便将音频发生器接入音响，音响也只会释放可听声波，而非次声波。通过重复播放相同0.05秒的声音也不能产生次声波，因为声音在空气中的传播波形周期并不符合次声波的要求。能量的不足和空气介质的高弹性是主要原因。类似地，水波震动也能产生次声波，但能量无法达到足够的水平，难以对复杂的生物结构产生影响。
次声波作为武器的一大挑战在于其传播缺乏指向性。由于波长过长，现代科技无法引导次声波朝某一方向传播，这意味在附近区域，无论是敌方还是友方都可能受到影响。因此，次声波的控制和应用需要克服巨大的技术难题。
