椰子水变红后不宜饮用。椰子水出现红色通常是因为椰子肉发生了变质。新鲜椰子水味道清甜且透明。即使椰子老化，其中的水通常仍可饮用，只是可能会出现一个圆形的芽球。变质的椰子水可能会有异味或异色，这是椰子水开始分解的标志。
椰子水的保存方法至关重要。椰子水在未开壳前处于无菌状态，但一旦开壳，其稳定性会迅速下降，易受微生物污染或酶的作用而变色，这会严重影响其感官品质和营养价值。为了有效保存椰子水，最佳方法是保持在椰子果本身内部。研究显示，新鲜椰子水在常温下可保持5至10天的新鲜度，而在12℃条件下，用PE膜包裹可保存28天，用PVC膜包裹则可保存30天。此外，采用石蜡涂膜包装可以获得长达49天的货架期。在低温2.5℃、相对湿度45%-55%的条件下，成熟椰子水可以贮藏超过2年。低温环境更有利于椰子水的贮藏，而在相同温度下，密封与非密封保存的时间并无显著差异。在37℃下，椰子水可保存5小时，24℃下可保存8小时，14℃下可保存22小时，而在4℃下则可保存达7天。
