个税退付手续费申请流程：
1、登录电子税务局,点击“退付手续费核对”;
2、点击“获取结报单”,通过“结报单”和“单户核对清册”得到申报记录,核对完成后点击“申请退库”;
3、在“代扣代缴手续费退费申请”中依次选择有关选项,然后提交,待税务部门审批完成后,就可以退还相应的手续费。
【本文所涉及的法律依据】：：
《个人所得税法》
第九条
个人所得税以所得人为纳税人，以支付所得的单位或者个人为扣缴义务人。 纳税人有中国公民身份号码的，以中国公民身份号码为纳税人识别号；纳税人没有中国公民身份号码的，由税务机关赋予其纳税人识别号。扣缴义务人扣缴税款时，纳税人应当向扣缴义务人提供纳税人识别号。