法律分析:
违法提供出口退税凭证罪的立案标准是:徇私舞弊，致使国家税收损失累计达10万元以上的；徇私舞弊，致使国家税收损失累计不满10万元，但具有索取、收受贿赂或者其他恶劣情节的；其他致使国家利益遭受重大损失的情形。
法律依据:
《最高人民检察院关于渎职侵权犯罪案件立案标准的规定》一（十六）
违法提供出口退税凭证案（第四百零五条第二款）
违法提供出口退税凭证罪是指海关、外汇管理等国家机关工作人员违反国家规定，在提供出口货物报关单、出口收汇核销单等出口退税凭证的工作中徇私舞弊，致使国家利益遭受重大损失的行为。
涉嫌下列情形之一的，应予立案:
1、徇私舞弊，致使国家税收损失累计达10万元以上的；
2、徇私舞弊，致使国家税收损失累计不满10万元，但具有索取、收受贿赂或者其他恶劣情节的；
3、其他致使国家利益遭受重大损失的情形。