职务侵占罪由公安机关立案侦查。职务侵占罪的主体不是国家安全机关工作人员，职务侵占罪是指刑法第四章规定的侵犯公民人身权利和民主权利的犯罪，特别主体是公司、企业或者其他单位的人员，包括保险公司人员，刑事案件的侦查由公安机关进行，法律另有规定的除外，这里所指的是检察机关直接侦查或者刑事侦查，除法院直接受理的案件外，显然不排除职务侵占罪。
一、如何区分贪污罪与职务侵占罪
犯罪客体不同。贪污罪是复杂客体，而职务侵占罪的客体是简单客体，只侵犯单位所有财产所有权；犯罪主体不同。本罪的主体是国家工作人员和受国家机关等，而职务侵占罪的主体则是公司企业中不具有国家工作人员身份的工作人员。
根据《刑法》第三百八十二条的规定，国家工作人员利用职务上的便利，侵吞、窃取、骗取或者以其他手段非法占有公共财物的，是贪污罪。
受国家机关、国有公司、企业、事业单位、人民团体委托管理、经营国有财产的人员，利用职务上的便利，侵吞、窃取、骗取或者以其他手段非法占有国有财物的，以贪污论。
与前两款所列人员勾结，伙同贪污的，以共犯论处。
二、员工职务侵占怎么处理
如果员工职务侵占的，在一般情况下，公司作为受害人，是需要及时向公安机关报案的。构成刑事案件的，公安机关是需要立案侦查的，人民法院是会以职务侵占罪定罪量刑的。
刑法规定，公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，处五年以下有期徒刑或者拘役;数额巨大的，处五年以上有期徒刑，可以并处没收财产。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国刑法》第二百七十一条，公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金;数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金;数额特别巨大的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金。国有公司、企业或者其他国有单位中从事公务的人员和国有公司、企业或者其他国有单位委派到非国有公司、企业以及其他单位从事公务的人员有前款行为的，依照本法第三百八十二条、第三百八十三条的规定定罪处罚。