1931到1937年是清华大学的蓬勃发展时期，当时梅贻琦任校长，开始广聘名师，实行名主治校，而且还建立起来了在我国工程教育史上有重要意义的清华工学院。这一时期被清华人称为“黄金时期”.
但是很不幸的是，1937年，抗日战争爆发，当时的北平非常不平静，很多大学开始南迁，清华大学首先南迁长沙，成立长沙临时大学，后来又迁到昆明，与北京大学、天津南开大学联合组成“国立西南联合大学”.抗日战争持续了8年，西南联大也坚持了8年
当时的条件非常艰苦，但是正是在这样的艰苦条件下，却是清华历史上出人才最多的时期之一，如最早获诺贝尔奖的物理学家杨政宁、李政道，中国“两弹元勋”邓稼先，都是毕业于西南联大时期;著名的民主人士闻一多、吴晗等，都在西南联大任教。当时西南联大的校训是“刚毅坚卓”,正是这四个字鼓励清华的学生们克服重重困难，不断进取。
抗日战争胜利后，1946年，清华大学才迁回清华园复校，当时只设了文、法、理、工、农等5个学院，共26个系。1952年，全国高校进行院系调整，清华大学响应国家发展工业的号召，调出文、法、理、农四个学院，其中文科基本上都并入了北京大学和人民大学，理科并入了北京大学，其他的院系则成立了一些新的学校，比如现在的北京农业大学
就是我们的农学院分出成立的，还有总理温__的母校中国地质大学，就是当时清华大学地质系分出后成立的，还有因为神州五号升空而名声大噪的北京航空航天大学，也是当时我们的航空航天系分出成立的。当时的清华大学，只留下了工学院，为国家培养了一大批工程技术人才，被称为“工程师的摇篮”.
1978年以来，清华大学进入了一个蓬勃发展的时期，逐步恢复了理科、文科、经济和管理类学科，并成立了研究生院和继续教育学院，1999年，原中央工艺美术学院并入，成立清华大学美术学院，20__年，在教育部批准下，我校成立了医学院，20__年4月成立新闻与传播学院，20__年5月18日，清华大学恢复了航空与航天系，并将他扩大为航空与航天学院，它的首任院长是神州五号的总设计师，清华大学1952级校友王永志先生。
清华大学发展到现在已经有了13个学院，53个系，成为了一所具有文、法、理、工、医、经济、管理、航空和艺术等学科的综合性大学。今天的清华大学面临着前所未有的历史机遇，全体师生员工的奋斗目标是：到20__年百年校庆之时，争取把清华大学建设成为具有中国特色的“综合性、研究型、开放式”的世界一流大学。