常用的荧光物质有很多，列举以下四种：
1、异硫氰酸荧光素，为黄色或橙黄色结晶粉末，易溶于水或酒精等溶剂，呈现明亮的黄绿色荧光。
2、四乙基罗丹明，为橘红色粉末，不溶于水，易溶于酒精和丙酮，性质稳定，可长期保存，呈橘红色荧光。
3、四甲基异硫氰酸罗丹明，最大吸引光波长为550纳米，最大发射光波长为620纳米，呈橙红色荧光，可配合用于双重标记或对比染色，其异硫氰基可与蛋白质结合，但荧光效率较低。
4、藻红蛋白，为无定形，褐红色粉末，不溶于水，易溶于酒精和丙酮，性质稳定，可长期保存，呈明亮的橙色荧光，故被广泛用于对比染色或用于两种不同颜色的荧光抗体的双重染色。
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