假植贮藏：将根部带土采收的芹菜，单株或多株（或成捆）直立栽于假植沟内，充分浇水，以后可视土壤湿度再浇水。沟顶盖草帘。经常检查质量，防止前期发热腐烂和后期受冻。
冻藏：在风障北侧建半地下式贮藏窖，在窖四周筑土墙，在南墙中间每隔1m左右垂直留通风筒，直通窖底。再在窖底挖通风沟与各通风筒相通；在窖北墙的贴地表处，挖进风口，通入窖内。窖底铺高粱秸，上覆细土。将成捆芹菜，根朝下倾斜紧排在窖内，装满后盖薄土。覆土后窖内温度保持-1～-2℃。出窖后，置0-2℃的条件下缓慢解冻。
气调冷藏：将带3cm短根的芹菜捆成小把，先在窖内-1～-2℃条件下预冷一两天后装入塑料袋，每袋开通风孔，调节袋内气体。然后入窖贮藏，保持窖温 0.5℃，空气相对湿度95%左右。