多缴纳的车船税退税流程如下：
1、纳税人向所在地的区地方税务局、税务所申请车船税退税，需提供《车船使用税退税申请表》或《误缴、溢缴退税申请表》及《车船使用税退税申请表》，均可在地税局税务所领取；
2、车船管理部门开具的与退税事由相对应的有关证明原件；
3、税务登记证、个人有效身份证件复印件；
4、办理退税车船的机动车行驶证或机动车登记证书；
5、车船税完税凭证明或保单和“保险业专用发票”；
6、支付退税的银行账号证明，个人为申请人银行存折、单位为银行印鉴卡；
7、被盗退税的，还需提交派出所出具的被盗立案证明及车管所开具的“停驶通知书”；
8、报废退税的，还需提交车管所出具的“注销通知书”；
9、所有资料全部提交完成后，税务局工作人员进行退税操作。
法律依据：《中华人民共和国车船税法》第六条
从事机动车第三者责任强制保险业务的保险机构为机动车车船税的扣缴义务人，应当在收取保险费时依法代收车船税，并出具代收税款凭证。